histcite

histcite官网下载,pro2.1使用教程,引文圖谱分析軟體

什么是histcite?

histcite＝history of cite，意味引文歷史，或者叫引文圖谱分析軟體，是一个基于引文的分析軟體。该軟體系sci的發明人加菲尔德開發，能够用圖示的方式展示某一领域不同文献之间的關系。可以快速帮助我们繪制出一个领域的發展歷史，定位出该领域的重要文献，以及最新的重要文献。

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HistCite是一款非常强大的Windows平台引文分析工具，可以根据Web of Science（WOS）資料库上導出的資料快速繪制出某个研究领域的發展脉络，快速鎖定某个研究方向的重要文献和学術大牛，还可以找到某些具有開創性成果的無指定關键词的論文。

HistCite即History of Cite，叫做引文歷史，或者叫引文圖谱分析軟體。该軟體系SCI的發明人加菲尔德開發，能够用圖示的方式展示某一领域不同文献之间的關系。可以快速帮助我们繪制出一个领域的發展歷史，定位出该领域的重要文献，以及最新的重要文献。

HistCite的分析步驟

包括两步

①首先透過检索，將文献限定在某一个主题范围内，这样搜到的文献都是你感興趣额的文献。这时候文献數量可能还会很大，超出阅讀范围；即便數量不大，也没法直接看出这些文献之间的關联；

②利用HistCite對检索到的文献进行分析，找出同行推荐的最重要的文献；

这些文献通常就是一个领域發展的里程碑式的文献。这就是HistCite分析的简要过程。当然，在此基礎上，HistCite还可以给我们提供更多的信息。如找出關键词遗漏的文献、重要的国家、机构和科学家、發展趋势、最新进展等。

如何使用HistCite

在使用前，首先要了解HistCite 这款軟體是 Thomson Reuters （汤森路透）公司開發的，和 WOS 是一家公司，所以 HistCite 只支持 WOS 資料库，對于 Scopus 等資料库则無能為力，不过 Github 上面有人寫了一个可以將 Scopus 導入 Histcite 进行分析的脚本[1]，有興趣的同学可以去試試看。使用流程主要分4个步驟：1、獲取資料，2、導入資料，3、統计分析，4、引證關系圖。下面將从这4个步驟依次介绍。1.獲取資料（1）在WOS上，選择核心合集【web of Science Core Collection】，输入检索關键词，例如输入【neuro】和【pain】，点擊【search】进行检索。

（2）检索結果保證在2000~3000左右，因為我们需要導出文献，但Web Of Science每次只能導出500篇，如果检索結果太多甚至上万，不方便我们導出。点擊【Export】，进行導出。点擊【Other File Formats】。分批次導出你需要的文献資料就可以啦。

2.導入資料

（1）打開軟體，把導出的文档拖入軟體里的【TXT】里

（2） 返回上一页面，点擊【main】

（3） 会自动弹出下列页面，输入【1】，点擊【Enter】键

3.統计分析（1）点擊【LCS】，對文章进行排序。LCS是Local citation score（本地引用次數），表示受同行的關注程度，LCS越大，說明此文献受到本领域關注越大，也就越值得我们去阅讀。GCS是Global citation score（全球引用次數），它包含其他领域、專業對这篇文献的關注度。一般LCS与GCS会有偏差。一篇文献可能受到的同行關注度較高，但受到其他领域的關注程度較低。我们一般關注LCS，以它對文献进行排序。LCR是Local cited references（当前資料库中被引用的文献）。CR是Cited reference（文章引用的参考文献數量）。

（2）左上角还有“Records”, “Authors”, “Journals”等可以以它们對文献进行分析。这里以【Words】為例。点擊【Words】

这里對關键词进行了排序分析，可以看出这个领域一些重要的關键词，有助于我们以后的文献關键词检索。

4.引證關系圖（1）点擊【Tools】里的【Graph Maker】（2）左侧“select by”選择【LCS】，【Limit】選择50，“size”選择【full】,点擊【Make Graph】。出现右侧的圖。每个圆圈表示一篇文献，中间的數字是这篇文献在資料库中的序号。其中圆圈大小代表LCS值，也就是受到同行關注的程度。圆圈越大，說明受到本领域關注程度越高。箭頭代表着每篇文献之间的联系，為我们梳理了此领域的脉络關系。

这張圖能更直觀地反映了分析結果[2]，有助于我们更好地理解。[1]對应GitHub网站：https://github.com/leoatchina/Scopus2Histcite[2]引用自：https://zhuanlan.zhihu.com/p/446729622

為什么選择VOSviewer

这个軟體支持WOS、PubMed、RIS等格式，非常简單、容易上手。但是这里存在一个問题，就是不支持CNKI，那么問题来了，应该怎么解决呢？方法就是將CNKI的資料格式轉成VOSviewer支持的格式——RIS格式。而格式轉换就需要用到NoteExpress軟體。

如何使用VOSviewer

1.在CNKI搜索文献，并選择【導出/参考文献】2.選择導出【NoteExpress】（保存时文件类型選择“所有文件”），此时就生成了NoteExpress軟體支持的CNKI原始資料，假設文件名為“CNKI-origin”3.打開NoteExpress軟體，然后在【文件】選项卡選择【導入题錄】，導入步驟②中的文件“CNKI-origin”

4.選中步驟（3）中導入的所有题錄，然后選择【文件】選项卡中的【導出题錄】注意：導出文件名后面一定要加上.ris后綴，并且使用样式為RefMan（RIS）Export。这样就完成了CNKI原始資料格式轉换為VOSviewer可視化軟體支持的RIS資料格式啦！

但是当把这个CNKI文献的RIS資料格式導入到VOSviewer的时候，你会發现一个神奇的现象，各个節点居然没有共现，是相互独立的，而且每个節点居然是好几个關键字連在一起。如下圖3。

然后透過VOSviewer資料導入过程中發现，原来我们轉换的RIS格式有問题！CNKI原始文献的關键字没有分開，而是變成了“城市社区；；公共文化需求”这样的形式，这样就導致關键字的“Total link strength”為0，这就意味着關键词之间没有任何共现關系，如圖4。

然后我们用notepad++軟體打開这个RIS格式的文件，發现格式是这样滴！（圖5）

但是VOSviewer要求的RIS样式是每个關键字的前面必须是“KW -”開頭，这样VOSviewer才能辨識所有的關键字。那我们怎么將圖5的RIS样式變成圖6那样的呢？咚咚咚，这就要用到notepad++軟體强大的替换功能啦！5.關键步驟：將RIS文件中的所有關键词词串分開成一个一个單独的關键字

用notepad++打開步驟（4）的RIS文件，然后選择【搜索】選项卡里的【替换】，然后將“;;”全部替换為“\nKW -”，表示將RIS文本中所有的“,, ,,”全部替换成以“KW -”為開頭。这样就把所有的關键字分開了，使VOSviewer能够辨識。这里用到了正则表示式，/n表示换行。

最終，CNKI的原始資料真正轉换為了VOSviewer軟體支持的RIS資料格式了，假設该文件名為“vos-supported.ris”。6.完成可視化操作①將vos-supported.ris導入到VOSviewer軟體中，按步驟一步一步完成。選择面板左侧的【create】，并勾選弹出框中的第二项；②選择導入RIS文件；

③選择關键词共现【co-occurrence-keywords】；

④按照實際需求调整阙值，控制共现關键字个數并選择關键字个數；

⑤最后可以看到所有的關键字都被分開辨識了，并且词共现强度都大于0了；

⑥点擊finish，完成最終的可視化。

最后就会出现这样的可視化結果啦~[3][3]

本文参見：https://zhuanlan.zhihu.com/p/43495785

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1.KNIME 成熟度很高的開源軟體，是用于創建資料科学应用程式和服務的開源軟體。KNIME更直觀，開放，不斷整合新的開發，使人们可以理解資料，設计資料科学工作流程和可重用组件。
2.MPLUS。不多介绍，在我的其他笔記里📒有推荐，还包括課程，也是本人最常用得軟體。
3.pointofix150 是一款熒屏标記軟體。
4.Python
5.R及RStudio R语言是為教学研究工作者設计的一种數学编程语言，主要用于統计分析、繪圖、資料挖掘。
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8.可視化軟體：bibexcel HistCite 这两款都是文献分析利器。